编为书院番六组、小姓组六组。此时，书院番头（兼任小姓组番头）是上杉氏虎年少时的近臣樋口兼续（樋口与六，樋口兼丰长子）、色部长影（色部胜长之侄）、新发田盛喜（新发田重家之弟）等人来担任。至于无法继承旗本家业的次男和三男，则是被上杉氏虎进行吸收，用于对书院番、小姓组、大番等军势进行一定增强和再编。